生物标志物手册 本书特色

本书原著由瑞士巴塞尔jain pharmabiotech (杰恩药物生物技术公司)的医学博士，kewal k. jain编写。全书内容丰富，全面总结了不同类型的生物标志物，介绍了发现生物标志物的各种方法，如如蛋白质组学、基因组学和代谢组学等各种组学技术，分子成像技术、纳米生物技术、生物信息学技术等，包括生物标志物评价的背景信息、验证步骤以及在临床试验中的运用。生物标志物作为本书的核心，按各种疾病分章节分别进行详细阐述，特别是疾病与生物标志物类别之间的关系，使读者能够全面了解现有生物标志物的种类、研究开发与应用已及未来的发展方向。本书适合医生、药物研发人员、高校及科研单位生物、化学、药学等相关领域的研究人员阅读。

生物标志物手册 内容简介

本书是对生物标志物现状的概述。生物标志物可以指示生理及病理过程以及对治疗措施的药理反应，是具有可以被客观测量并评价等特点的指标。生物标志物不仅是诊断分析发展的基础，也是确定新药研发靶标的基础。《生物标志物手册》这本书的一个重要特色是将疾病和生物标志物的分类联系了起来，可为读者分类已有的生物标志物和发现未来的生物标志物提供指导。对于科学家、医生以及从事药物研发工作的人来说，本书是重要的生物标志物的信息来源。本书的原著作者是从事生物标志物一线工作者，经验丰富，具有科研阅历与市场经验，全面了解生物标志物的动性，及其在临床医学领域的应用情况。

生物标志物手册 目录

第1章绪论1
1.1定义1
1.2历史上的生物标志物2
1.3生物标志物的分类2
1.3.1响应治疗措施的生物标志物3
1.3.2药物动力学/药效学的生物标志物4
1.3.3预测生物标志物4
1.3.4有效生物标志物4
1.4生物标志物的类型5
1.4.1基因作为生物标志物5
1.4.2蛋白质作为生物标志物6
1.4.3蛋白质组学6
1.4.4dna生物标志物7
1.4.5线粒体dna7
1.4.6线粒体突变7
1.4.7rna生物标志物7
1.4.8转录组学8
1.4.9微rna9
1.4.10代谢物组学9
1.4.11糖组学10
1.4.12单核苷酸多态性10
1.4.13单体型分析10
1.4.14疾病的细胞生物标志物11
1.4.15干细胞生物标志物11
1.4.16癌症干细胞生物标志物12
1.4.17内皮糖蛋白作为干细胞的功能性生物标志物12
1.4.18p75ntr作为分离脂肪组织来源干细胞的生物标志物12
1.4.19蛋白质表达谱作为干细胞生物标志物13
1.4.20stempro(r) ezchektm用于分析人类胚胎干细胞（hesc）
生物标志物13
1.4.21阶段特异性胚胎抗原4（ssea-4）作为骨髓间充质干细胞
（msc）的生物标志物13
1.4.22自身抗体作为自身免疫性疾病的生物标志物14
1.5理想的生物标志物15
1.6生物标志物和系统生物学15
1.7生物标志物与其他技术及医疗保健的关系17
1.7.1生物标志物和转化医学17
1.7.2医疗保健中使用生物标志物的局限性18
第2章用于发现生物标志物的技术19
2.1引言19
2.2生物标志物在组织和体液内的检测19
2.3呼吸中的疾病生物标志物19
2.3.1挥发性有机化合物的便携式呼吸检测20
2.3.2通过感知技术检测呼吸生物标志物20
2.3.3光频梳光谱检测呼吸生物标志物20
2.4基因组技术21
2.4.1基因表达21
2.4.2组织微阵列用于生物标志物研究23
2.5表观基因组技术23
2.6蛋白质组学技术25
2.6.1二维凝胶电泳（2d ge）26
2.6.2同位素亲和标签26
2.6.3质谱仪27
2.6.4液相色谱-ms联用31
2.6.5蛋白质断层扫描技术31
2.6.6蛋白质生物芯片/微阵列和生物标志物31
2.6.7实时pcr用于蛋白质生物标志物的定量32
2.6.8磁珠用于蛋白质生物标志物的发现33
2.6.9cellcarta(r)蛋白质组学平台33
2.6.10masstermindtm33
2.6.11体液中寻找生物标志物34
2.6.12血浆中蛋白质生物标志物发现的挑战和对策34
2.6.13尿液蛋白质组中的生物标志物38
2.6.14体液和组织中的多肽作为疾病生物标志物38
2.6.15蛋白质生物标志物的实验室间的重现性验证40
2.6.16不同组织中相似蛋白质生物标志物的意义41
2.7糖组学技术41
2.8代谢物组学技术42
2.8.1基于ms的试剂盒用于发现血浆中的代谢生物标志物42
2.8.2毛细管电泳用于尿液分析43
2.8.3脂质分析43
2.8.4代谢物组学在生物标志物鉴定和类型识别中的作用43
2.8.5大规模人类代谢物组学研究中生物标志物的验证44
2.9脂类组学44
2.10生物标志物的荧光指示剂45
2.11分子成像技术45
2.11.1计算机断层扫描46
2.11.2磁共振成像46
2.11.3正电子发射断层扫描46
2.11.4成像生物标志物的优点47
2.11.5分子成像用于监测体内基因表达47
2.11.6体内分子成像作为生物标志物48
2.11.7分子成像面临的挑战和未来的前景48
2.11.8临床实践中的分子成像49
2.12核磁共振49
2.12.1化学衍生化提高nmr的生物标志物检测50
2.12.2代谢通量组学50
2.13纳米生物技术50
2.13.1纳米材料用于生物标记51
2.13.2纳米蛋白质组学和生物标志物53
2.13.3纳米粒子用于分子成像53
2.13.4纳米粒子用于生物标志物发现54
2.13.5核蛋白纳米器件用于癌症生物标志物的检测54
2.13.6纳米生物技术在生物标志物中应用的未来展望55
2.14生物信息学55
2.14.1生物标志物的工作流程指南55
2.14.2微阵列数据分析用于选择有用的生物标志物55
2.14.3生物信息学在蛋白质组学生物标志物发现中的作用56
2.14.4生物信息学在癌症生物标志物检测中的作用56
2.14.5生物标志物数据库57
2.14.6基因网络作为生物标志物57
2.15生物标志物发现和发展中的误区58
第3章生物标志物与分子诊断59
3.1引言59
3.2分子诊断技术59
3.2.1聚合酶链反应59
3.2.2pcr-elisa联合法61
3.2.3非pcr方法61
3.2.4转录介导的扩增62
3.2.5基因表达的快速分析62
3.2.6wave核苷酸片段分析系统62
3.2.7共轭小沟结合物dna探针63
3.2.8滚环扩增技术64
3.2.9环-环扩增65
3.2.10生物芯片和微阵列66
3.3mirna检测和表达分析67
3.3.1实时pcr用于mirna基因表达分析68
3.3.2利用lna探讨mirna68
3.3.3微阵列用于mirna基因表达分析68
第4章生物标志物用于药物发现与开发70
4.1引言70
4.2生物标志物技术用于药物发现71
4.2.1蛋白质组学生物标志物用于药物发现71
4.2.2化学蛋白质组学71
4.2.3转录组学用于药物发现72
4.2.4代谢物组学用于药物发现72
4.3生物标志物和药物安全73
4.3.1药物不良反应的生物标志物73
4.3.2生物标志物在药物安全性研究中的应用74
4.3.3基因组学技术用于毒理学生物标志物74
4.3.4蛋白质组学技术用于毒理学生物标志物75
4.3.5代谢组学技术用于毒理学生物标志物75
4.3.6集成基因组学和代谢组学数据用于开发毒性生物标志物75
4.3.7基于生物标志物的毒理学研究76
4.4生物标志物用于药物开发80
4.4.1代谢组学/代谢物组学在药物开发中的应用80
4.4.2药代动力学/药效学生物标志物在药物开发中的作用80
4.4.3分子成像作为生物标志物用于药物开发81
4.4.4临床试验中的生物标志物84
4.4.5制药公司对生物标志物的应用86
4.4.6心血管疾病的药物开发87
4.4.7神经系统疾病的药物开发87
4.4.8基于生物标志物的药物开发的未来展望88
第5章医疗保健中生物标志物的作用91
5.1引言91
5.2炎症生物标志物91
5.3氧化应激的生物标志物92
5.3.1氧化dna损伤92
5.3.2蛋白质作为疾病中氧化应激的生物标志物92
5.3.31,4-二羟基壬烷巯基尿酸92
5.3.4代谢性疾病的生物标志物92
5.4免疫疾病的生物标志物97
5.4.1移植器官衰竭的生物标志物97
5.4.2系统性红斑狼疮100
5.5肌肉骨骼疾病的生物标志物102
5.5.1类风湿性关节炎的生物标志物102
5.5.2脊椎关节炎的生物标志物102
5.5.3骨关节炎的生物标志物103
5.6骨质疏松症的生物标志物105
5.6.1双x线骨密度仪105
5.6.2定量ct和mri骨骼成像105
5.6.3骨质疏松症生物标志物的检测方法105
5.6.4感染性疾病的生物标志物106
5.6.5蛋白质组学用于发现感染生物标志物108
5.6.6全身炎症反应综合征109
5.6.7肺结核109
5.6.8病毒感染的生物标志物111
5.6.9寄生虫感染的生物标志物114
5.7肝脏疾病的生物标志物116
5.7.1肝脏疾病的呼吸生物标志物116
5.7.2病毒性乙肝和丙肝的生物标志物116
5.7.3肝损伤的生物标志物117
5.7.4肝硬化的生物标志物118
5.7.5fibromax118
5.8胰腺炎的生物标志物118
5.9肾脏疾病的生物标志物119
5.9.1胱抑素c作为肾小球滤过率的生物标志物119
5.9.2急性肾损伤的蛋白质组学生物标志物119
5.9.3狼疮性肾炎的生物标志物120
5.9.4糖尿病肾病的生物标志物120
5.10肺部疾病的生物标志物120
5.10.1肺部疾病中氧化应激的生物标志物121
5.10.2急性呼吸窘迫综合征存活的生物标志物122
5.10.3肺表面活性蛋白作为肺疾病的生物标志物122
5.10.4慢性阻塞性肺病的生物标志物123
5.10.5哮喘的生物标志物124
5.10.6囊性纤维化的生物标志物127
5.10.7肺动脉栓塞的生物标志物128
5.11妇产科中的生物标志物128
5.11.1先兆子痫的生物标志物128
5.11.2早产的生物标志物131
5.11.3并发性妊娠中的氧化应激生物标志物132
5.11.4经前焦虑症的生物标志物132
5.11.5子宫内膜异位症的生物标志物132
5.11.6母体血液中的胎儿生物标志物133
5.12遗传病的生物标志物133
5.12.1唐氏综合征的生物标志物133
5.12.2肌肉营养不良症的生物标志物134
5.12.3苯丙酮尿症的生物标志物134
5.12.4溶酶体贮积症的生物标志物135
5.13衰老的生物标志物136
5.13.1在遗传同质化人群中研究衰老的生物标志物138
5.13.2基因作为衰老的生物标志物138
5.13.3生物信息学在搜索衰老生物标志物中的作用139
5.13.4热量限制对长寿生物标志物的影响139
5.14其他失调的生物标志物139
5.14.1炎症性肠病的生物标志物139
5.14.2勃起功能障碍的生物标志物140
5.14.3中暑的生物标志物141
5.14.4疼痛的生物标志物141
5.14.5鼻一氧化氮作为鼻窦炎治疗反应的生物标志物143
5.14.6多种疾病共有的生物标志物143
5.15生物标志物和营养144
5.15.1营养流行病学中的生物标志物144
5.15.2营养状况的生物标志物144
5.15.3支链氨基酸状态的生物标志物145
5.15.4热量限制的生物标志物145
5.15.5营养不良的生物标志物145
5.15.6蛋白质组学生物标志物和营养145
5.16人类疾病中基因-环境相互作用的生物标志物146
5.17未来生物标志物在卫生保健中的作用146
5.18卫生保健以外生物标志物的应用147
5.18.1应对生物恐怖主义147
5.18.2监测环境毒素人体暴露的生物标志物147
5.18.3动物保健中生物标志物的应用148
第6章癌症生物标志物149
6.1引言149
6.1.1理想的癌症生物标志物149
6.1.2癌症单个和多个生物标志物的对比150
6.2癌症生物标志物的类别151
6.2.1mirna作为癌症生物标志物152
6.2.2癌症中表观基因沉默的生物标志物155
6.2.3癌症的免疫生物标志物155
6.3癌症的分子诊断技术156
6.4用于检测癌症生物标志物的技术157
6.4.1基因组学技术用于癌症生物标志物157
6.4.2组织微阵列用于研究癌症生物标志物161
6.4.3癌症的分子指纹图谱162
6.4.4癌症中的炎症生物标志物163
6.4.5用于检测癌症生物标志物的蛋白质组学技术163
6.4.6癌症的代谢组学生物标志物171
6.4.7表位组学用于癌症的早期检测172
6.4.8dna甲基化生物标志物的检测173
6.4.9纳米生物技术用于癌症的早期检测以改善治疗177
6.4.10相比正常组织癌症中选择性表达的生物标志物177
6.4.11超声辐射增强肿瘤生物标志物的释放177
6.4.12癌症生物标志物的体内成像178
6.4.13激肽释放酶基因家族与癌症生物标志物179
6.4.14血液中的循环癌细胞作为癌症生物标志物180
6.5癌症生物标志物的应用181
6.5.1使用生物标志物进行癌症分类181
6.5.2使用生物标志物用于癌症早期检测181
6.5.3生物标志物在癌症诊断中的应用182
6.5.4生物标志物在癌症的诊断和治疗中的应用183
6.5.5用于癌症治疗效果评价的生物标志物184
6.5.6血管生成生物标志物用于开发抗血管生成疗法186
6.5.7癌症耐药性的生物标志物188
6.5.8放射暴露的生物标志物189
6.6生物标志物在肿瘤药物开发中的作用189
6.6.1肿瘤分子成像作为药物开发的指南190
6.6.2头发中的生物标志物用于评估癌症治疗191
6.6.3抗癌药物的分子靶标作为生物标志物192
6.6.4肿瘤学研究中的安全性生物标志物192
6.6.5生物标志物在抗癌药物i期临床试验中的作用192
6.7依据肿瘤位置/类型的生物标志物193
6.7.1膀胱癌的生物标志物193
6.7.2脑肿瘤的生物标志物194
6.7.3乳腺癌的生物标志物198
6.7.4宫颈癌生物标志物212
6.7.5胃肠道癌症生物标志物214
6.7.6头颈部癌219
6.7.7白血病的生物标志物219
6.7.8肝癌的生物标志物223
6.7.9肺癌的生物标志物224
6.7.10恶性胸膜间皮瘤231
6.7.11黑色素瘤的生物标志物232
6.7.12鼻咽癌生物标志物234
6.7.13口腔癌的生物标志物236
6.7.14卵巢癌的生物标志物237
6.7.15胰腺癌的生物标志物241
6.7.16前列腺癌245
6.7.17肾肿瘤生物标志物253
6.7.18甲状腺癌的生物标志物255
6.8nci对癌症生物标志物的作用257
6.8.1癌症易感性遗传标志物项目257
6.8.2肿瘤生物标志物鉴定计划258
6.8.3nci在癌症生物标志物开发和验证中的作用258
6.9癌症生物标志物的未来前景259
6.9.1学术机构的癌症生物标志物研究259
6.9.2癌症生物标志物发现的未来的前景和挑战259
第7章神经系统疾病生物标志物261
7.1引言261
7.2神经系统疾病生物标志物的发现261
7.2.1利用蛋白质组学进行csf生物标志物识别262
7.2.2利用脂类组学进行csf生物标志物识别263
7.2.3脑微透析技术用于脑代谢的生物标志物研究263
7.2.4血液中的cns疾病的蛋白质生物标志物的检测264
7.2.5脑成像用于生物标志物的检测264
7.3神经系统疾病生物标志物的数据挖掘264
7.4抗体作为神经系统疾病的生物标志物264
7.5神经再生的生物标志物265
7.6血脑屏障损伤的生物标志物265
7.7神经毒性的生物标志物266
7.7.1胶质原纤维酸性蛋白作为神经毒性的生物标志物266
7.7.2单链dna作为神经元凋亡的生物标志物266
7.8神经退行性疾病的生物标志物267
7.8.1阿尔茨海默病的生物标志物267
7.8.2帕金森病的生物标志物283
7.8.3亨廷顿病的生物标志物286
7.8.4威尔逊病的生物标志物287
7.8.5肌萎缩侧索硬化症的生物标志物288
7.8.6hiv-1感染患者中痴呆症的生物标志物291
7.8.7朊病毒疾病的生物标志物291
7.9多发性硬化症的生物标志物292
7.9.1多发性硬化症中的抗体293
7.9.2t细胞作为多发性硬化症的生物标志物295
7.9.3凝溶胶蛋白作为多发性硬化症的生物标志物295
7.9.4多发性硬化症患者生物标志物的基因表达分析296
7.9.5多发性硬化症中血清蛋白质组学模式分析296
7.9.6髓鞘再生和修复的生物标志物296
7.9.7多发性硬化症治疗反应的生物标志物297
7.9.8多发性硬化症生物标志物的结语和未来展望297
7.10脑卒中的生物标志物298
7.10.1脑内出血的生物标志物300
7.10.2缺氧性脑损伤的生物标志物300
7.10.3脑利钠肽作为心源性脑卒中的生物标志物300
7.10.4脑乳酸和n-乙酰天冬氨酸作为脑卒中的生物标志物301
7.10.5细胞间黏附分子1作为缺血性脑卒中的生物标志物301
7.10.6lp-pla2和crp作为脑卒中的生物标志物301
7.10.7神经丝氨酸蛋白酶抑制剂基因多态性作为生物标志物302
7.10.8nmda受体作为脑卒中的兴奋毒性的生物标志物302
7.10.9核小体作为脑卒中的生物标志物302
7.10.10park7和核苷二磷酸激酶作为脑卒中的生物标志物303
7.10.11visinen样蛋白1303
7.10.12缺血性脑卒中后血液中的基因表达303
7.10.13脑卒中生物标志物的未来前景304
7.11创伤性脑损伤的生物标志物304
7.11.1确定tbi生物标志物的技术手段305
7.11.2tbi的生物标志物307
7.11.3婴儿中受tbi损伤的生物标志物308
7.11.4创伤性脑损伤（tbi）生物标志物的临床应用309
7.12中枢神经系统（cns）感染的生物标志物309
7.12.1中枢神经系统感染艾滋病毒的生物标志物310
7.12.2细菌性脑膜炎的生物标志物310
7.13癫痫的生物标志物310
7.13.1遗传癫痫311
7.13.2癫痫的生化标志物311
7.13.3癫痫的成像生物标志物312
7.13.4正常压力脑积水的生物标志物312
7.14视网膜疾病的生物标志物312
7.14.1年龄相关性黄斑变性的生物标志物312
7.15自闭症的生物标志物313
7.16睡眠障碍的生物标志物314
7.16.1白天过度嗜睡的生物标志物314
7.16.2阻塞性睡眠呼吸暂停的生物标志物315
7.16.3不宁腿综合征的生物标志物315
7.17精神疾病的生物标志物316
7.17.1抑郁症的生物标志物316
7.17.2精神病的生物标志物316
7.17.3精神分裂症的生物标志物317
第8章心血管疾病的生物标志物319
8.1引言319
8.2心血管疾病的生物标志物319
心血管疾病的遗传生物标志物321
8.3鉴定心血管疾病生物标志物的方法323
8.3.1蛋白质组学在心血管疾病生物标志物方面的应用323
8.3.2唾液中心肌梗死生物标志物的检测323
8.3.3代谢组学技术用于心肌缺血的生物标志物323
8.3.4心血管疾病的影像学标志物324
8.4心血管疾病的生物标志物的应用325
8.4.1缺血性心脏病和心肌梗死的生物标志物325
8.4.2充血性心力衰竭的生物标志物329
8.4.3动脉粥样硬化的标志物332
8.4.4冠心病危险因素的生物标志物334
8.4.5肺动脉高压的生物标志物336
8.4.6心血管疾病的遗传标志物337
8.4.7预测因心血管病死亡的多个生物标志物341
8.5生物标志物在管理心血管疾病中的作用341
8.5.1生物标志物在心肌梗死诊断中的作用341
8.5.2生物标志物在预防心血管疾病中的作用342
8.5.3分子特征分析用于心血管疾病的管理342
8.5.4c反应蛋白作为响应他汀类药物治疗的生物标志物343
8.5.5循环标志物的作用和心血管功能障碍的炎症介质343
8.5.6管理外周动脉疾病的生物标志物的使用344
8.5.7管理高血压的生物标志物的使用344
8.5.8监测急性冠状动脉综合征的蛋白质标志物的使用344
8.5.9监测心血管疾病的多个生物标志物的使用345
8.6心血管疾病生物标志物的前景346
8.6.1心血管生物标志物联盟346
8.6.2研究心血管疾病的生物标志物的系统方法346
第9章生物标志物和个体化医疗348
9.1引言348
9.2遗传药理学348
9.3药物基因组学350
9.4药物蛋白质组学351
9.5生物标志物在个性化药物发展中的作用352
9.6欧盟的生物样本库，生物标记和个体化医疗352
9.7表达标记作为诊断/预测工具353
9.8生物标志物用来监测治疗效果354
9.9生物标志物为基础的个体化医疗用于药物救援354
9.10生物标志物在个体化医疗的未来角色355
第10章监管问题356
10.1引言356
10.2生物效应求证356
10.2.1一种有效生物标志物的fda标准357
10.2.2nist在验证癌症标志物中的作用358
10.2.3bnp和nt-probnp作为心脏生物
标志物检测的质量规范358
10.3fda对生物标志物在临床试验中的观点359
10.4fda和预测性药物361
10.5生物标志物和fda的自愿基因组数据提交361
10.6成像标志物在核准药物中的作用361
10.7fda关键路径的计划和生物标志物的研发362
10.7.1fda联合会将遗传标记链接到严重不良反应事件362
10.7.2肿瘤生物标记验证项目363
10.7.3关键性路径行动计划364
10.7.4从生物标志物验证试验到临床实验室诊断366
10.7.5快速路径项目367
10.7.6迫切需要一个联邦机构监管标志物领域367
参考文献368