第1章 原核生物系统学概论
1.1 原核生物资源的多样性及重要性
1.1.1 代谢类型的多样性
1.1.2 生境的广泛性
1.1.3 生活方式的多样性
1.1.4 遗传多样性
1.2 原核生物分类学和系统学的概念以及原核生物种的定义
1.2.1 原核牛物分类学和系统学
1.2.2 原核生物“种”的概念
1.3 原核牛物分类简史
1.4 原核生物系统学研究进展与成就
1.4.1 Woese的成就、古菌的发现及其分类学意义
1.4.2 “复制基冈树”和“蛋白质系统学”
1.4.3 “基因组系统学”(Phylogenomics)
1.4.4 以全基因组为基础的氨基酸组分矢量法在原核生物系统学中的应用
1.5 原核生物系统学与其他学科的关系
1.6 《伯杰氏系统细菌学手册》第2版简介
参考文献
第2章 细菌命名法规及其在原核生物分类中的应用
2.1 国际细菌命名法规
2.1.1 俗名和学名
2.1.2 早期生物命名简况
2.1.3 命名法规的性质和意义
2.1.4 细菌命名法规的缘起
2.1.5 国际细菌命名法规的内容简介
2.1.6 名称的优先权和发表
2.1.7 名称的引用
2.1.8 异物同名和同物异名
2.1.9 细菌名称及其有关信息的查询
2.1.10 汉译细菌名称
2.1.11 公认名称与非公认名称的使用
2.2 与细菌分类和命名有关的闷际学术机构及其相关刊物
2.3 《细菌名称的确认名录》
2.4 细菌名称的合格化及其于续
2.4.1 新名称和(或)新组合被国际学术界所承认的一般要求
2.4.2 有效发表的合格化
2.5 细菌名称的应用
2.6 对不合法规的细菌命名的更名
2.6.1 细菌命名的原则
2.6.2 对细菌命名违规的处理示例
2.7 原核生物分类中暂定名称的分类地位
2.7.1 原核生物暂定名称的概念
2.7.2 确立暂定名称的原核生物应注意的要点
2.7.3 暂定名称原核生物系统学示例
2.8 国际生物命名法规的协调与统一
2.8.1 生物命名法规协调与统一的背景
2.8.2 生物命名统一法规(BioCode)的设想和活动
2.8.3 生物命名法规统一对细菌命名的影响
参考文献
第3章 生物信息学在原核生物分类中的作用
第4章 菌种保藏在原核生物分类学研究中的作用
第5章 原核生物多相分类技术与应用
第6章 原核生物的分子生态学研究
第7章 古菌域
第8章 细菌域第Ⅰ至第Ⅸ门
第9章 细菌域第Ⅹ门——蓝细菌门
第10章 细菌域第Ⅺ门
第11章 细菌域变形杆菌门
第12章 低GC含量革兰阳性细菌
第13章 放线菌
第14章 细菌域第ⅩⅤ门至ⅩⅦ门
第15章 细菌域ⅩⅧ门至ⅩⅢ门
附录
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